국세청은 지난 97년 이후 합병 및 분할 등 구조조정 법인들에 대한 세무처리의 적정성 여부에 대해 지속적으로 세무조사를 실시하고 있다.
제조업에 이어 금융 증권 등 구조조정 관련 법인들에 대해서는 지난해 부터 순차적으로 조사를 시행해 왔다.